Der Fußballverein wurde als Sektion Fußball der TSU (Turnsportunion) Bergheim im Jahr 1965 gegründet. Nach einer Fusion mit seinem lokalen Konkurrenten SK Kasern (damals Absteiger aus der 1. Klasse Nord) trat der damals in der 2. Klasse Nord B spielende Verein als SU (Sportunion) Bergheim-Kasern und schließlich seit dem 26. Jänner 2004 als FC Bergheim auf.

Sportlicher Verlauf
Der Verein stieg in der Saison 1965/66 in den Spielbetrieb der 3. Klasse A ein und kämpfte sich bald in die 2. Klasse hoch. 1970/71 spielte der Verein erstmals in der 1. Klasse Nord - damals die vierthöchste Spielklasse in Österreich! 1973/74 qualifizierte sich der Verein für die neu geschaffene "Landesklasse", die als neue Spielstufe zwischen der Salzburger Liga und der 1. Klasse Nord geschaffen wurde. Allerdings konnte dort der Klassenerhalt nicht gesichert werden.

Mit dem Wiederaufstieg 1976/77 endete die bisher wohl erfolgreichste Phase des Klubs: Nach dem Abstieg 1979/80 spielte man für zehn Jahre in der 1. Klasse Nord, bis man schließlich 1989/90 in die 2. Klasse absteigen musste. Da nach der Saison 1992/93 auch der Lokalkonkurrent aus der ersten Klasse abstieg, versuchte man durch eine Fusion die Kräfte zu bündeln. Der Aufstieg in die 1. Klasse Nord sollte allerdings erst wieder in der Saison 1999/2000 gelingen. In der Saison Saison 2007/08 reichte der Vizemeistertitel dank günstiger Konstellationen in den oberen Ligen zum Aufstieg in die 2. Landesliga Nord.

In der 2015/16 wurde der Verein Meister der Salzburger Liga, verzichtete aber auf den Aufstieg, um der Damenmannschaft den Aufstieg in die Bundesliga zu ermöglichen.

TITEL UND ERFOLGE